Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms