Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmod2Q3UHZ5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms