Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms