Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bop1P97452 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bop1P97452 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms