Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme1P97371 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme1P97371 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme1P97371 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme1P97371 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms