Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms