Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhoP15409 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhoP15409 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhoP15409 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhoP15409 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoP15409 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoP15409 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoP15409 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoP15409 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoP15409 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoP15409 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhoP15409 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms