Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms