Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vamp4O70480 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms