Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms