Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms