Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trappc8E9PWG2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms