Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hacd4A2AKM2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hacd4A2AKM2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hacd4A2AKM2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hacd4A2AKM2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hacd4A2AKM2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 619.1 ms