Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms