Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Cldn19Q9ET38 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Cldn19Q9ET38 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Cldn19Q9ET38 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn19Q9ET38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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