Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irx6Q9ER75 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms