Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms