Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2Q8CDM1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2Q8CDM1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms