Protein–RNA interactions for Protein: Q80W69

Uncharacterized protein C12orf71 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80W69 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q80W69 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q80W69 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q80W69 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q80W69 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q80W69 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q80W69 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q80W69 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q80W69 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q80W69 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms