Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup214Q80U93 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup214Q80U93 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms