Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms