Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms