Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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