Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms