Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GastP48757 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GastP48757 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GastP48757 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GastP48757 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GastP48757 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GastP48757 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GastP48757 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GastP48757 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GastP48757 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GastP48757 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GastP48757 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GastP48757 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GastP48757 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GastP48757 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms