Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms