Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm5cP41230 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms