Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb9P28076 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.5 ms