Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoP15409 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhoP15409 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhoP15409 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RhoP15409 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhoP15409 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RhoP15409 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RhoP15409 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RhoP15409 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RhoP15409 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms