Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prf1P10820 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prf1P10820 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prf1P10820 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms