Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb3P09026 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb3P09026 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms