Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp4O70480 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms