Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4aF8VPX6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms