Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8444F6XS56 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms