Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6030445D17RikE9Q8F9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms