Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM2

1700003H04Rik, RIKEN cDNA 1700003H04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003H04RikE9PXM2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700003H04RikE9PXM2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700003H04RikE9PXM2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700003H04RikE9PXM2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700003H04RikE9PXM2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700003H04RikE9PXM2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700003H04RikE9PXM2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms