Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Catsperg2C6KI89 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms