Protein–RNA interactions for Protein: B1AYH9

Gm13271, MCG146419, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13271B1AYH9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gm13271B1AYH9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Gm13271B1AYH9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Gm13271B1AYH9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Gm13271B1AYH9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm13271B1AYH9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Gm13271B1AYH9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm13271B1AYH9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms