Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a3A2ACT7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms