Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc27A2A6Q5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc27A2A6Q5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc27A2A6Q5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.3 ms