Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PnckQ9QYK9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms