Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Cldn19Q9ET38 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Cldn19Q9ET38 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Cldn19Q9ET38 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Cldn19Q9ET38 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Cldn19Q9ET38 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Cldn19Q9ET38 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Cldn19Q9ET38 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Cldn19Q9ET38 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn19Q9ET38 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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