Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms