Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk4Q8VEJ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms