Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad2Q8CDM1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms