Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snapc4Q8BP86 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snapc4Q8BP86 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snapc4Q8BP86 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms