Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med16Q6PGF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms