Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2surpQ6NV83 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms