Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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