Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms